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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café. |
Data corrente: |
05/02/2015 |
Data da última atualização: |
06/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CARDOSO, D. C.; MARTINATI, J. C.; GIACHETTO, P. F.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. |
Afiliação: |
DANIELLE C. CARDOSO, IAC; JULIANA C MARTINATI, IAC; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; RAMON O. VIDAL; MARCELO F. CARAZZOLLE; LILIAN PADILHA, SAPC; OLIVEIRO GUERREIRO-FILHO, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, SAPC. |
Título: |
Large-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 15, p. 1-20, 2014. |
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-66 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach. |
Palavras-Chave: |
Microarranjo; Plant defense. |
Thesagro: |
Café; Coffea Arábica. |
Thesaurus Nal: |
Genes; Leafminers; Microarray technology. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117310/1/Large-scale-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 01841naa a2200301 a 4500 001 2007801 005 2015-02-06 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/1471-2164-15-66$2DOI 100 1 $aCARDOSO, D. C. 245 $aLarge-scale analysis of differential gene expression in coffee genotypes resistant and susceptible to leaf miner-toward the identification of candidate genes for marker assisted-selection.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aA successful development of herbivorous insects into plant tissues depends on coordination of metabolic processes. Plants have evolved complex mechanisms to recognize such attacks, and to trigger a defense response. To understand the transcriptional basis of this response, we compare gene expression profiles of two coffee genotypes, susceptible and resistant to leaf miner (Leucoptera coffella). A total of 22000 EST sequences from the Coffee Genome Database were selected for a microarray analysis. Fluorescence probes were synthesized using mRNA from the infested and non-infested coffee plants. Array hybridization, scanning and data normalization were performed using Nimble Scan® e ArrayStar® platforms. Genes with foldchange values +/-2 were considered differentially expressed. A validation of 18 differentially expressed genes was performed in infected plants using qRT-PCR approach. 650 $aGenes 650 $aLeafminers 650 $aMicroarray technology 650 $aCafé 650 $aCoffea Arábica 653 $aMicroarranjo 653 $aPlant defense 700 1 $aMARTINATI, J. C. 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aVIDAL, R. O. 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 700 1 $aPADILHA, L. 700 1 $aGUERREIRO-FILHO, O. 700 1 $aMALUF, M. P. 773 $tBMC Genomics, London$gv. 15, p. 1-20, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Registros recuperados : 37 | |
22. | | RIBEIRO, T. S.; MARQUES, M. R. H.; PEREIRA, F. M. V.; SCRAMIN, J.; CORREA, T. R. A.; COLNAGO, L. A.; BERNARDES FILHO, R.; FORATO, L. A. Aplicação da ressonância magnética nuclear no domínio do tempo e análise exploratória de peras revestidas com filmes a base de zeínas In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 6., 2012, Fortaleza. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação; Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2012. p. 105-107. Editores: Maria Alice Martins, MOrsyleide de Freitas Rosa, Men de Sá Moreira de Souza Filho, Nicodemos Moreira dos Santos Junior, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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23. | | PIGATIN, L. B. F.; MUSSI, M.; ALMEIDA, T. L. de; MARTELLI, L. F. de A.; PEREIRA, F. M. V.; BORSATO, A. V.; MARTIN NETO, L. Cultivo de ocimum benth em casa de vegetação sob a aplicação de compostos orgânicos originados de resíduos agroindustriais e urbanos. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste, 2010. p. 58. (Embrapa Instrumentação Agropecuária. Documentos, 50).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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24. | | MOREIRA, L. F. P. P.; FERRARI, A. C.; MORAES, T. B.; REIS, R. A.; PEREIRA, F. M. V.; COLNAGO, L. A. Prediction of beef color using time-domain nuclear magnetic resonance (TD-NMR) relaxometry data and multivariate analyses Magnetic Resonance in Chemistry, [S.l.], v. 54, p. 800-804, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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25. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Evaluation of the effects of Candidatus Liberibacter asiaticus on inoculated citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) and chemometrics tools. Talanta, Oxford, v. 83, n. 2, p. 351-356, dez. 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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26. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Evaluation of the effects of candidatus liberibacter asiaticus on inoculated citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy (LIBS) and chemometrics tools. Talanta, Oxford, v. 83, p. 351-356, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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27. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Evaluations of the effects of candidatus liberibacter asiaticus on inoculated citrus plants using laser-induced breakdown spectroscopy and chemometric tools. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 95, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas. 1CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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28. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Fluorescence images combined to chemometrics for the investigation of plants inoculated with candidatus liberibacter asiaticus In: CHEMOMETRICS IN ANALYTICAL CHEMISTRY - CAC, 12., 2010, Antwerp, Belgium. Book of abstracts... Antwerp: Universiteit Antwerpen, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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29. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENANCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTUA, J. Fluorescence images combined to statistic test for fingerprinting of citrus plants after bacterial infection. Analytical methods, [S. l.], v. 3, p. 552-556, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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31. | | RUSSO, M. S. T.; CARDINALI, M.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA, F. M. V.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTÚA, J. Study of laser-induced fluorescence imaging in asymptomatic leaves from citrus plants inoculated with candidatus liberibacter. Citrus research & technology, Cordeirópolis, v. 31, suplemento, p. 122, 2010. Proceedings of the 18 conference international organization citrus virologists, 2010, Campinas.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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32. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; CARDINALI, M. C. do B.; BOAS, P. R. V.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Métodos analíticos desenvolvidos para o monitoramento da doença citrus greening em laranja doce: imagens de fluorescência e espectroscopia de emissão óptica com plasma induzido por laser (LIBS). São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2011. 43 p. il. (Embrapa Instrumentação. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 35).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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33. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; CARDINALI, M. C. do B.; BOAS, P. R. V.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTUA, J. Métodos analíticos desenvolvidos para o monitoramento da doença citrus greening em laranja doce: imagens de fluorescência e espectroscopia de emissão óptica com plasma induzido por laser (LIBS). São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2011. 42 p. (Embrapa Instrumentação. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 35).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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34. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. DE S. T.; CARDINALI, M. DO B.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Laser-induced fluorescence imaging method to monitor citrus greening disease. Computers and Electronics in Agriculture, v. 79, n. 12, p. 90-93, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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35. | | PEREIRA, F. M. V.; MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA-FILHO, E. R.; VENÂNCIO, A. L.; RUSSO, M. de S. T.; CARDINALI, M. C. do B.; MARTINS, P. K.; FREITAS-ASTUA, J. Laser-induced fluorescence imaging method to monitor citrus greening disease. Computers and Electronics in Agriculture, Amsterdam, v. 79, n. 1, p. 90-93, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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36. | | SILVA, D. C. P. da; RIBEIRO, P. P. E.; JORGE, L. A. de C.; PAIVA, M. S. V. de; MILORI, D. M. B. P.; GONÇALVES, D. S.; CARVALHO, C. M.; VENÂNCIO, A. L.; PEREIRA, F. M. V. Extração de características para geração de um classificador para detecção precoce do HLB em citros In: WORKSHOP DE VISÃO COMPUTACIONAL, 6., 2010, Presidente Prudente, São Paulo. Anais... Presidente Prudente: FCT/UNESP, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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37. | | MILORI, D. M. B. P.; PEREIRA, F. M. V.; VILLAS-BOAS, P. R.; CARDINALI, M. C. do B.; MARTIN-NETO, L.; FERREIRA, E. J.; MARTINS, P. K.; ASTUA, J. de F. Diagnóstico do HLB por técnicas fotônicas. In: ANDRADE, D. J.; FERREIRA, M. da C.; MARTINELLI, N. M. (Ed.). Aspectos da fitossanidade em citros. Jaboticabal: Cultura Acadêmica, 2014. p. 143-180.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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